Meskipun dikatakan bahwa kegiatan penelitian agraria yang sebaik-baiknya sangat penting dilakukan, pada kenyataannya tidak ada atau belum ada metodologi yang khas untuk penelitian agraria. Persoalan metodologi ini juga seringkali dianggap sebagai hal yang sepele dan kerap diabaikan oleh para peneliti. Dalam kompleksitas masalah agraria yang ada seperti masalah lingkungan dan ekologi, masalah konflik, masalah gerakan tani, masalah hubungan kekuasaan, relasi gender dan lain-lain, dimungkinkan adanya metodologi tertentu yang khas. Kebutuhan untuk mengelaborasi kemungkinan pengembangan metodologi yang khusus semacam ini cukup penting.